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Hieff NGS™ MaxUP II DNA Library Prep Kit  ——文庫轉化率高達60%,極其适用FFPE、cfDNA樣本

——建庫試劑盒中的全能王


圖片2.jpg

 

1、産品概述

Hieff NGS® MaxUpII DNA Library Prep Kit for Illumina®,可用于NGS測序中DNA樣本文庫構建,采用高質量的酶學組成,改進型接頭連接技術,以及具有強擴增效率的高保真酶,顯著提高文庫轉化率與擴增效率,Input DNA範圍為500 pg-1 μg,适用包含cfDNA、FFPE在内的所有樣本進行文庫構建,産品可以應用于全基因組測序、靶向捕獲測序、Chip-seq等測序方法中。


2、産品特點

 
适用樣本類型廣:包含cfDNA、FFPE在内的所有樣本均能獲得優異文庫和測序質量

應用範圍廣:産品可應用于全基因組測序、靶向捕獲測序、Chip-seq等等

高品質酶學組成:業界領先的接頭連接效率,高達60%、超高保真性和超強擴增效率

品質穩定:嚴格的批次性能與穩定性質控


3、操作流程


精簡的操作步驟,2-2.5小時快速建庫

image.png

 

4、産品優勢


1)文庫轉化效率高達60%

image.png

 

1  Agilent  2100 檢測350bp平末端DNA片段單端和雙端連接産物峰

0:350bpDNA片段峰、1:單端接頭連接産物峰、2:雙端接頭連接産物峰。測試基于各公司的标準 protocol進行。

image.png 

2 接頭連接效率百分比(%)。

對圖1峰面積進行積分後的定量結果顯示Hieff NGS™ MaxUp II Kit 的雙端連接效率可達60%


2)擴增效率高,兼容不同GC含量樣本

使用具有強擴增效率的Super CanaceTM High-Fidelity Mix用于文庫擴增,效率更高。

産品名稱

GC 38% (ng)

GC 50% (ng)

GC 70% (ng)

Super Canace® High-Fidelity Mix

25.6

18

17.1

K*-HiFi mix

15.8

16.7

21.1

1 ng GC含量分别為38%、50%、70%的400 bp DNA片段為起始樣本,12 cycles擴增。


3)文庫産量高

樣本

100 ng FFPE

5 ng cfDNA

7 cycles (ng)

10 cycles (ng)

9 cycles (ng)

12 cycles (ng)

MaxUP II

400

2000

120

1200

K* 品牌

150

1100

100

1080

FFPE和cfDNA為起始樣本建庫,相對同類型試劑盒品牌 K*,在相同擴增循環數下,獲得更多文庫産量。

4)數據無偏好性

在不同GC含量樣本中,使用Hieff NGS™ MaxUP II Kit均能獲得堿基質量好且覆蓋度均一的測序數據。

樣本

Mapped Reads (%)

Coverage (%)

Average

10×

15×

20×

蠟狀芽孢杆菌(GC 34%)

93.8

99.644

99.643

99.641

99.639

99.638

大腸杆菌(GC 51%)

92.7

93.057

92.782

92.687

92.625

92.579

嗜鹽杆菌(GC 65%)

94.2

99.598

99.028

98.391

97.885

97.419

image.png

 

3不同GC含量樣本測序偏好性圖譜


5、客戶反饋


5.1建庫産量高

1)杭州某生物公司邁*

洗相同條件下對比實驗,脫體積32 μL,對比文庫産量,翊聖MaxUpII文庫産量比K*文庫産量更高


MaxUp II

K* Hyper

Input DNA

50 ng

25 ng

10 ng

50 ng

25 ng

10 ng

循環數 (cycles)

7

9

13

7

9

13

文庫濃度 (ng/µL)

15.4

23.8

58.2

8.76

13.5

52.4
 


 image.png

  圖4 對比文庫質量峰圖,翊聖MaxUpII文庫主峰單一,大小與目的片段的大小一緻,K*品牌建庫試劑盒出現多峰的現象

2)北京某基因技術有限公司中*

gDNA樣本(NA12878),平行實驗中,翊聖建庫試劑盒MaxUpII與K*品牌對比,文庫質量和産量基本一緻,在捕獲建庫中能兼容不同的捕獲試劑!

樣本名稱

Pre試劑盒

Pre-pcr酶

起始投入量(ng)

Pre-pcr循環數

Pre-pcr濃度(ng/μL)

雜交捕獲試劑

Post-pcr循環數

Post-pcr濃度(ng/μL)

K1

K*

K*

100

9

116

SureSelect XT

11

3.62

K2

K*

K*

100

9

116

自制

11

5.58

Y1

YEASEN

K*

100

9

96

SureSelect XT

11

2.98

Y2

YEASEN

K*

100

9

95.2

SureSelect XT

11

2.62

Y3

YEASEN

K*

100

9

99.6

自制

11

6.14

Y4

YEASEN

K*

100

9

96.4

自制

11

4.88

5.2文庫對應測序更為準确

1)上海某醫學檢驗所渥*

Input DNA

ctDNA


ctDNA


Library Prep Kit

K* Hyper


Yeasen MaxUp II


Adapter

K*


Yeasen


Clean Beads

AMPure XP


Yeasen


Panel

homemade (0.7 M)

腫瘤用藥相關的區域

homemade (0.7 M)

腫瘤用藥相關的區域

Target enrichment Kit

Roche NimbleGen


Roche NimbleGen


Number of reads

69,584,944


84,254,863


Mapped reads

69,443,695

99.80%

84,061,118

99.77%

Duplicate Reads skipped

33,619,961

48.31%

36,539,873

43.37%

Region size/percentage of reference

603,967

0.02%

603,967

0.02%

Mapped reads(in region)

37,974,721

54.57%

46,955,235

55.73%

Duplicated Reads(in region)

23,393,464

61.60%

28,074,535

59.79%

Unduplicated mapped reads(in region)

14,581,257

20.95%

15,831,372

18.79%

Coverage Mean

30,324,926


32,898,505


Insert size P25/Median/P75

155/170/192


153/168/188


image.png

 

5 K*品牌與翊聖MaxUpII建庫試劑盒測序數據對比柱狀圖

 

訂購信息

産品

貨号

規格

價格(元)

Hieff NGSTM MaxUP II DNA Library Prep Kit for Illumina®

12200ES08/24/96

8/24/96libraries

2456/6486/23567


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名稱

貨号

規格

價格(元)

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12607ES24/96

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2×Super Canace® II High-Fidelity Mix for Library Amplification

12621ES24/96

24/96 T

583/1783

接頭

完整接頭

Hieff  NGS® Complete Adapter Kit

for Illumina,

12615/6/7/8ES04/16

12×4/12×16 T

1256/4536

短接頭

Hieff NGS®  96 Single Index Primer Kit for Illumina®

12611/2ES02

48×2 T

1493

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12613/4ES02

96×2 T

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12601ES56/75

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